Szkoła jako jednostka organizacyjna Powiatu Iławskiego podlega kontroli zgodnie z planem kontroli na kolejny rok kalendarzowy przyjętym zarządzeniem Starosty Iławskiego. Określone są  zasady i tryb przeprowadzanych kontroli w jednostce. Z poszczególnych kontroli sporządzane są sprawozdania i zarządzenia pokontrolne.

Jednostka podlega również audytowi wewnętrznemu zgodnie z przyjętym przez Zarząd Powiatu Iławskiego planem audytu na kolejny rok kalendarzowy. Systematycznie szkoła kontrolowana jest przez Kuratora Oświaty, obserwowany jest przebieg egzaminów maturalnych i egzaminów potwierdzających kwalifikacje zawodowe. Ponadto kontrolują szkołę : Państwowa Inspekcja Sanitarno-Epidemiologiczna, Państwowa Straż Pożarna, Państwowa Inspekcja Pracy.

Dyrektor Szkoły przeprowadza również kontrole planowane i doraźne oraz ewaluację obszarów w zakresie kontroli zarządczej oraz nadzoru pedagogicznego nad działalnością placówki.