Zespół Szkół im. Bohaterów Września 1939 roku w Iławie jest jednostką organizacyjną powiatu iławskiego tak więc powiat iławskie jest organem prowadzącym szkoły. Szkoła prowadzi działalność oświatową.

1. Szkoła realizuje cele i zadania określone w Ustawie o systemie oświaty z dnia 7 września 1991 roku (z późniejszymi zmianami) oraz w przepisach wydanych na jej podstawie.
2. Zapewnia uczniom wykształcenie ogólne umożliwiające dalszą naukę.
3. Przygotowuje do czynnego i świadomego uczestnictwa w życiu narodowym, społecznym i politycznym.
4. Sprawuje opiekę nad uczniami odpowiednio do ich potrzeb i możliwości szkoły.

Realizację zadań wynikających z ustawy szkoła zapewnia przez:
1. Organizowanie i prowadzenie zajęć lekcyjnych na wysokim poziomie z uwzględnieniem  indywidualnych możliwości uczniów.
2. Zagwarantowanie poczucia tożsamości narodowej, etnicznej i religijnej.
3. Pomoc psychologiczną i pedagogiczną uczniom koordynowaną przez pedagoga szkolnego, który ściśle współpracuje z poradnią psychologiczno-pedagogiczną, organizuje pedagogizację rodziców, udziela pomocy i wskazówek wychowawcom klas.
4. Organizowanie kół i zespołów zainteresowań, sekcji sportowych zgodnie z potrzebami uczniów i możliwościami finansowymi i kadrowymi szkoły. Rozwijanie zainteresowań i uzdolnień uczniów odbywa się również przez inicjowanie szkolnych konkursów i olimpiad oraz uczestnictwo w tych formach współzawodnictwa organizowanych w środowisku i przez jednostki nadrzędne oświaty-bazowe i kadrowe uwarunkowania w pracy pozalekcyjnej szkoły tworzą największe możliwości do rozwoju zainteresowań uczniów w dziedzinie muzyki (instrumenty dęte), sportu (piłka siatkowa, koszykowa, tenis stołowy, lekkoatletyka), plastyki i telewizji (szkolne studio TV).

Opiekę nad uczniami szkoła sprawuje przez:
1. Zapewnienie wszystkim chętnym uczniom miejsc w internacie.
2. Umożliwienie spożywania posiłków wszystkim uczniom.
3. Opiekę nad młodzieżą dojeżdżającą przez dostosowanie czasu pracy świetlicy szkolnej, czytelni, biblioteki i bufetu.
4. Mimo iż szkoła nie jest przystosowana do potrzeb osób niepełnosprawnych, dokłada wszelkich starań, otacza troską, życzliwością i opieką pobierających w niej naukę uczniów niepełnosprawnych.
5. Pełnienie dyżurów przez nauczycieli przed lekcjami i w czasie przerw we wszystkich miejscach przebywania młodzieży.
6. Współpracę administracji szkolnej i pracowników obsługi z pracownikami pedagogicznymi.
7. Zapewnienie bezpiecznych i zgodnych z wymogami higieny warunków nauki. Sprawy bezpieczeństwa i higieny koordynuje technik bhp.
8. Umożliwienie korzystania z pomocy finansowej uczniom będącym w szczególnie trudnej sytuacji materialnej. Środki mogą pochodzić z budżetu szkoły, z Rady Szkoły oraz z ośrodków pomocy społecznej.
9. W szkole pracuje Szkolna Komisja do Spraw Pomocy Materialnej, która przyznaje stypendia socjalne zgodnie z wewnętrznym regulaminem.
10. Szkoła współpracuje ze środowiskiem rodzinnym. Zasady współpracy reguluje Program Wychowawczy Szkoły, Wewnątrzszkolny System Oceniania oraz Regulamin Szkolnych Działań Interwencyjnych.